技术是核心，服务是宗旨

扩增子测序

►【服务介绍】

 

扩增子测序主要通过对特定长度的PCR 产物进行测序分析，针对环境样本，16S/18S/ITS 等基因扩增子测序是研究环境微生物多样性及群落组成差异的重要技术手段之一。

 

►【提供的服务】

 

根据不同的研究目的和需求，我们提供3 种扩增子产品：16S rDNA 测序、ITS 测序及目标区域扩增子测序。具体介绍如下：

 

♦16S rDNA 测序

 

16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA 的DNA 序列，具有10个保守区域和9个高变区域(V1-V9)，其中保守区在细菌间差异不大，高变区具有属或种的特异性，对16S rDNA某个高变区进行测序，用于研究环境微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。

16s-rdna

♦ITS 测序

 

ITS 分为两个区域：ITS1 和ITS2，ITS1 位于真核生物rDNA 序列18S 和5.8S 之间，ITS2 位于真核生物rDNA 序列5.8S 和28S 之间。对ITS1 或ITS2 进行测序，用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。

its-rdna

♦目标区域扩增子测序

 

根据客户的研究需求，利用第二代高通量测序技术，对某些目标基因的PCR 产物提供测序及分析服务。

 

►【技术流程】

 

Amplicon

 

 

►【试验周期】

 

 目标区域扩增子测序HiSeq2500 PE250 5w/10w 条Tags 45 个自然日。

 

►【样品要求】

 

  • 常见环境样本（请使用干冰或冰袋运送）：土壤、淤泥、沉积物 ≥ 3 g；粪便 ≥ 500 mg；组织样本 ≥ 1 g；

  • 水体送样为过滤后的滤膜( 最适滤膜直径3-4 cm，孔径大小一般选择0.22 μm 或者0.45 μm)；

  • 拭子样本≥ 2 个；

  • DNA/PCR 产物（请使用干冰或冰袋运送）；

  • DNA：浓度 ≥ 5 ng/μl，总量 ≥ 150 ng；DNA 要有明显主带，无降解，无RNA、蛋白质等杂质污染；

  • PCR 产物：浓度 ≥ 20 ng/μl，总量 ≥ 400 ng，片段大小 < 450 bp，条带单一，无降解，无引物二聚体。

 

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weixin