细菌16S区序列分析
►【服务介绍】
细菌的rRNA 是细胞内含量最多的RNA，约占RNA 总量的80% 以上，由高度保守区和可变区组成。细菌的rRNA 包括5S、 16S、 23S，其中5S rRNA 信息量少，不适合分析。23S rRNA 尽管分子大，信息量多，但碱基突变速度较快，同样不适用于细菌鉴定。16S rDNA 是编码原核生物核糖体小亚基rRNA（16S rRNA）的DNA 序列，相比之下遗传较为稳定，长度在1550±200 bp 左右，代表信息量适中，可以用于研究系统进化。目前已经报道了10,000 种以上的细菌16S rDNA 序列。
►【技术流程】
技术流程图
16s rRNA示意图
►【样品要求及注意事项】
- 基因组DNA：OD 260/280 在1.8-2.0 之间（OD260/230 最好大于1.5），浓度 ≥ 30 ng/μl, 体积 ≥ 20 μl，且无明显降解；
- 建议提供培养过的菌液，体积>2 ml，请确保提供的菌液是经过分离培养的单菌落，因样本不纯造成的测序双峰，将全额收取实验费用；
- 特殊样品, 如放线菌、厌氧菌等，请直接提供基因组DNA，革兰氏阳性菌，建议提供基因组DNA；
- 不接受有致病性的样品, 如果菌体带有致病性，请提供菌体的基因组DNA，并进行加热处理以杀死致病菌；
- 由于有些真菌形态与细菌相似，难以判断，在无法获得16S rDNA 结果时，建议考虑进行真菌ITS 区序列分析；
- 对于测序双峰的样本，我们可以提供克隆测序的服务。
►【交付结果】
- 测序峰图及序列文件
- 16S rDNA 序列拼接文件
- 序列分析比对结果
►【服务价格】
| 项目内容 | 样品类型 | 价格（元/样品） |
| 细菌16S区序列分析 | 基因组 | 220 |
| 菌液 | 280 |
注：对于测序双峰的样品，我们可提供克隆测序服务，价格：300 元/ 样品；包含：片段克隆，4 个阳性克隆测序，序列比对分析。
真菌ITS区序列分析
►【服务介绍】
真菌基因组中编码核糖体RNA 的基因有4 种，28S rDNA、5S rDNA、18S rDNA 和5.8S rDNA，其中 18S、 5.8S 和 28S rDNA基因组成一个转录单元，其间的间隔区为ITS (Internal Transcribed Space) 基因，包括ITS1 及ITS2 两部分。ITS 区基因进化速度快，具有多态性，适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。利用rDNA 的保守序列设计引物，PCR 扩增未知真菌的ITS 区，测序后与GenBank 中已知的序列进行同源性比较，将未知真菌鉴定到属或种。
►【技术流程】
技术流程图
ITS示意图
►【样品要求及注意事项】
- 基因组DNA：OD 260/280 在1.8-2.0 之间（OD260/230 最好大于1.5），浓度 ≥ 30 ng/μl, 体积 ≥ 20 μl，且无明显降解；
- 建议提供培养过的菌液，体积>2 ml，请确保提供的菌液是经过分离培养的单菌落，因样本不纯造成的测序双峰，将全额收取实验费用；
- 特殊样品, 如酵母菌、丝状真菌等，请直接提供基因组DNA；
- 不接受有致病性的样品，如果菌体带有致病性，请提供菌体的基因组DNA，并将其进行加热处理以杀死致病菌；
- 由于有些细菌形态与真菌相似，难以判断，在无法获得ITS 结果时，建议考虑进行细菌16S 区序列分析；
- 对于测序双峰的样本，我们可以提供克隆测序的服务。
►【交付结果】
- 测序峰图及序列文件
- ITS 区序列拼接文件
- 序列分析比对结果
►【服务价格】
| 项目内容 | 样品类型 | 价格（元/样品） |
| 真菌ITS区序列分析 | 基因组 | 240 |
| 菌液 | 300 |
注：对于测序双峰的样品，我们可提供克隆测序服务，价格：300 元/ 样品；包含：片段克隆，随机挑选4 个阳性克隆测序，序列比对分析。
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