技术是核心，服务是宗旨

 

转录组测序（编码蛋白质的RNA和长链非编码RNA测序）

 

►【服务介绍】

     

      转录组，广义上指在相同环境（或生理条件）下的一个细胞、组织或生物体中出现的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA；狭义上则指细胞所能转录出的所有mRNA。转录组测序是研究细胞表型和功能的一个重要手段，可以在细胞或组织水平上对整个转录组的时空表达进行分析。利用高通量测序技术进行转录组测序是一种跨界、可靠、有效的获得转录组信息的手段。相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更精确的定量信息，更高的检测通量以及更广泛的检测范围，是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。通过对转录本表达分析可以快速发现新基因，并对SNP和lnDel变异、可变剪切、融合基因进行鉴定分析。

 

►【技术流程】

 

Transcriptome

 

►【实验周期】

 

产品

策略

推荐数据量

周期

真核有参转录组

HiseqPE150

6 Gb、8 Gb、10 Gb、12 Gb clean data

40天

真核无参转录组

无参拼接至少8 Gb clean data

50天

表达谱

HiseqPE150/50SE

3 Gb clean data/10M

40天

 

 

►【样品要求】

 

  • 转录组样品：RNA样品总量: ≥ 1.0 μg，RNA样品浓度:  ≥ 50 ng/μl；

  • 样品浓度和纯度：样品浓度 > 100 ng/μl，OD260/280 介于1.8-2.0之间，无肉眼可见污染；

  • 样品质量：使用Agilent Bioanalyzer 仪器检测，则获得的总的RNA 28S：18S > 1，RIN 动物 > 7，RIN植物 > 6.5；

  • 样品选择：对于细菌和真菌样品，希望尽量来自于同一个菌株，不要有宿主DNA污染；

  • 样品保存：请选择乙醇、DEPC水保存样品，并在样品信息单中注明；

  • 样品运输：样品请置于1.5 ml管中，并使用封口膜封好后干冰运输，请勿反复冻融。

 

官方微信

 

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